Çevrimiçi kurs – Toronto Üniversitesi’nin bitki biyoenformatik yöntemlerinde sertifikalı profesyonel uzmanlık

Teknoloji, sağlık, kültür ve daha fazlası dahil olmak üzere çeşitli konulardaki en ilginç bilgileri keşfedin. İlham veren içerik ve profesyonel bilgiler için web sitemizi ziyaret edin.

Suggested by: Coursera (What is Coursera?)

Professional Certificate

başlangıç

No prior knowledge required

Time to complete the course

7-day free trial

No unnecessary risks

Skills you will acquire in the course

  • öğrenme teknikleri
  • Analitik düşünme
  • problem çözme
  • iletişim becerileri
  • ekip çalışması
  • zaman yönetimi
  • Sunum becerileri
  • Yaratıcı düşünme
  • Stratejik düşünceler
  • Araştırma becerileri

What you will learn in the course

Courses for which the course is suitable

  • moleküler biyolog
  • Biyoenformatikçi
  • Bitki biyolojisi alanında araştırmacı
  • RNA-seq verilerini analiz edin
  • Filogenetik uzmanı
  • Biyoinformatik araçların geliştiricisi
  • Protein-protein etkileşimlerini araştırır
  • Genom veri analizörü
  • Biyolojide veri madenciliği uzmanı
  • Promotörleri ve genetik ağları analiz eder

Staj – dört derslik bir dizi

Son 15 yıldır bitki biyolojisi alanında heyecan verici değişiklikler yaşanıyor. Yüzlerce bitki genomu dizilendi ve tarandı, RNA-seq teknolojisi gen ekspresyonunun geniş düzeyde profilinin çıkarılmasını sağladı ve “-seq” bazlı yöntemlerin yayılması, proteinler arasındaki ve proteinler ile DNA arasındaki etkileşimlerin belirli bir düzeyde belirlenmesini mümkün kıldı. uygun fiyatlarla ve büyük miktarlarda. Bu veri setleri, bir fare tıklamasıyla veya ekrana dokunarak hipotezler oluşturmamıza olanak tanır.

Kurs içeriği

  • Biyoenformatik alanındaki temel beceriler ve araçlar:
    • NCBI Gen Bankası
    • Büyük patlama
    • Çoklu dizi hizalamaları
    • Biyoinformatik yöntemleri kullanarak filogenetik I
  • Protein-protein etkileşimleri
  • Yapısal biyoinformatik
  • Biyoinformatik yöntemler kullanılarak RNA-seq analizi II
  • Bitkiler için 33 benzersiz çevrimiçi araç:
    • Genom tarayıcıları
    • RNA veri madenciliği
    • Destekleyici ve ağ analizleri
  • Bitki biyoenformatiğinde son ders:
    • Genin biyolojik bir rolü olduğu hipotezini öne süren işlevi bilinmiyor
    • Yazılı bir laboratuvar raporundaki özet

Stajın amacı

Bu uzmanlık, bitkiler alanında araştırmacıların kullanabileceği etkileyici verilere ulaşmak isteyen herhangi bir modern moleküler biyolog için faydalıdır. Dersler sırasında Biyoinformatik II yöntemlerinde R programlamaya bazı girişler yapılır, ancak araçların çoğu çevrimiçi uygulamalardır.

teknik gereksinimler
  • Bir dizüstü veya masaüstü bilgisayara erişiminizin olması önerilir.
  • Araçlar telefon veya tabletteki mobil uygulamalar olarak çalışmayabilir.

Uygulamalı öğrenme projesi

Coursera’daki Bitki Biyoinformatiği uzmanlığı, NCBI’nin Genbank’ı, Blast, çoklu dizi hizalamaları ve Biyoinformatik I’deki filogenetik gibi temel biyoinformatik becerilerini ve araçlarını tanıtıyor ve ardından Biyoinformatik II’de protein-protein etkileşimleri, yapısal biyoinformatik ve RNA-seq analizi geliyor. Bitki biyoinformatiği dersine, genom tarayıcılarından RNA veri madenciliğine, promoter ve ağ analizlerine ve daha fazlasına kadar bitkilere özgü 33 çevrimiçi araç dahil ediyoruz. işlevi bilinmiyor; yazılı bir laboratuvar raporunda Özet yer alıyor.

Details of the courses that make up the specialization

Biyoinformatik Yöntemler I

Kurs 1 • 19 saat • 4,7 (1.721 değerlendirme)

Kurs detayları

ne öğreneceksin

  • İnsan genomunun dizilenmesi ve RNA-seq, mikrodiziler ve diğer teknolojileri kullanarak gen ekspresyonunun araştırılması gibi biyolojideki önemli projeler, biyologlar için zengin miktarda veri üretmiştir.
  • Bilim adamlarının karşılaştığı zorluk, incelenen sistemle ilgili yararlı bilgiler üretmek için bu verileri analiz etmek ve hatta bunlara erişmektir.
  • Ders, bol miktarda veriye erişmek ve ortalama bir biyologun aklına gelebilecek soruları yanıtlamak için mevcut biyoenformatik kaynakların (çoğunlukla internetteki programlar ve web siteleri) kullanılmasına odaklanmaktadır.
  • Konular şunları içerir: çoklu dizi hizalaması, filogenetik, gen ekspresyonu verilerinin analizi ve protein etkileşim ağları.
İlk bölüm
  • Biyoinformatik Yöntemler I (it), veri tabanları, Blast, çoklu dizi hizalaması, filogenetik, seçim analizi ve metagenomikle ilgilenir.
İkinci bölüm
  • Biyoinformatik Yöntemler II, motif bulma, protein-protein etkileşimleri, yapısal biyoinformatik, gen ekspresyonu veri analizi ve cis-element tahmini ile ilgilenir.

kazanacağınız beceriler

  • Kategori: genetik analiz
  • Kategori: Biyoenformatik analiz
  • Kategori: Evrim
  • Kategori: Karşılaştırmalı Genomik

Biyoinformatik Yöntemler II

Kurs 2 • 18 saat • 4,7 (478 değerlendirme)

Kurs detayları

ne öğreneceksin

  • İnsan genomunun dizilenmesi ve RNA-seq, mikrodiziler ve diğer teknolojileri kullanarak gen ekspresyonunun araştırılması gibi biyolojideki önemli projeler, biyologlar için zengin miktarda veri üretmiştir.
  • Bilim adamlarının karşılaştığı zorluk, incelenen sistemle ilgili yararlı bilgiler üretmek için bu verileri analiz etmek ve hatta bunlara erişmektir.
  • Ders, bol miktarda veriye erişmek ve ortalama bir biyologun aklına gelebilecek soruları yanıtlamak için mevcut biyoenformatik kaynakların (çoğunlukla internetteki programlar ve web siteleri) kullanılmasına odaklanmaktadır.
İlk bölüm
  • Biyoinformatik Yöntemler Veritabanları, Blast, çoklu dizi hizalaması, filogenetik, seçim analizi ve meta-genomik ile ilgilendim.
Bu ikinci kısım
  • Biyoinformatik Yöntemler II, motif keşfini, protein-protein etkileşimlerini, yapısal biyoinformatiği, gen ekspresyonu veri analizini ve cis-element tahminini kapsayacaktır.

kazanacağınız beceriler

  • Birçok biyoinformatik araç kullanma.

Bitki Biyoinformatiği

Kurs 3 • 13 saat • 4,8 (240 değerlendirme)

Kurs detayları

ne öğreneceksin

  • Geçtiğimiz 15 yıl bitki biyolojisi alanında heyecan verici geçti.
  • Yüzlerce bitki genomu dizilendi, RNA dizisi geniş bir ekspresyon profiline olanak sağladı.
  • “-seq” temelli yöntemlerin artması, protein-protein ve protein-DNA etkileşimlerinin kolay ve yüksek miktarda belirlenmesini mümkün kılmıştır.
  • Bu veriler bir fare tıklamasıyla hipotezler oluşturmamızı sağlar.

yapı

  • Altı pratik modülün her biri yaklaşık altı hafta sürer.
  • Yaklaşık 2 dakikalık bir giriş, yaklaşık 20 dakikalık teorik ders, bir buçuk saatlik uygulamalı laboratuvar.
  • Laboratuvarda zorluklar varsa yaklaşık 20 dakika laboratuvar tartışması ve yaklaşık 2 dakika özet.

Kapsanan yemekler [Haziran 2024’te güncellenen malzemeler]

  • Modül 1: Genomik veritabanları / önceden hesaplanmış gen ağaçları / protein araçları.
  • Modül 2: ifade araçları.
  • Modül 3: Birlikte ifade araçları.
  • Modül 4: Promoter Analizi.
  • Modül 5: GO zenginleştirme analizi ve yol görselleştirmesi.
  • Modül 6: Ağları Keşfetmek.

Bitki biyoenformatiğinde ileri düzey kurs

Kurs 4 • 9 saat • 4,7 (27 değerlendirme)

Kurs detayları

ne öğreneceksin

  • Geçtiğimiz 15 yıl bitki biyolojisi alanında heyecan verici geçti.
  • Yüzlerce bitki genomu dizilendi, RNA dizisi geniş bir ekspresyon profiline olanak sağladı.
  • Bu derste işlevi bilinmeyen bir genin biyolojik rolünü varsaymak için araçlar kullanacağız.

Bu ders bitki biyoenformatiği uzmanlığının bir parçasıdır

  • Temel biyoenformatik becerileri ve içeriği tanıtır.
  • Toronto Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi’nin finansmanıyla geliştirildi.