Curso en línea – especialización profesional certificada en métodos de bioinformática vegetal de la Universidad de Toronto

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Professional Certificate

a partir de

No prior knowledge required

Time to complete the course

7-day free trial

No unnecessary risks

Skills you will acquire in the course

  • técnicas de aprendizaje
  • Pensamiento analítico
  • resolución de problemas
  • habilidades de comunicacion
  • trabajo en equipo
  • gestión del tiempo
  • Habilidades de presentación
  • Pensamiento creativo
  • Pensamientos estratégicos
  • Habilidades de investigación

What you will learn in the course

Courses for which the course is suitable

  • biólogo molecular
  • Bioinformático
  • Investigador en el campo de la biología vegetal.
  • Analizar datos de RNA-seq
  • Experto en filogenética
  • Desarrollador de herramientas bioinformáticas.
  • Investiga las interacciones proteína-proteína.
  • Analizador de datos del genoma.
  • Experto en minería de datos en biología.
  • Analiza promotores y redes genéticas.

Pasantía: una serie de cuatro cursos.

Durante los últimos 15 años se han producido cambios apasionantes en el campo de la biología vegetal. Se han secuenciado y escaneado cientos de genomas de plantas, la tecnología RNA-seq ha permitido perfilar la expresión genética a un nivel amplio, y la difusión de métodos basados ​​en «-seq» ha hecho posible determinar las interacciones entre proteínas y entre proteínas y ADN a nivel Precios asequibles y en grandes cantidades. Estos conjuntos de datos nos permiten generar hipótesis con solo hacer clic en el mouse o tocar la pantalla.

Contenido del curso

  • Habilidades y herramientas básicas en el campo de la bioinformática:
    • Banco de energía del NCBI
    • Explosión
    • Alineamientos de secuencias múltiples
    • Filogenética utilizando métodos bioinformáticos I.
  • Interacciones proteína-proteína
  • Bioinformática estructural
  • Análisis de RNA-seq mediante métodos bioinformáticos II.
  • 33 herramientas en línea únicas para plantas:
    • Navegadores de genoma
    • Minería de datos de ARN
    • Análisis de promotores y redes.
  • Curso final de bioinformática vegetal:
    • Se plantea la hipótesis de un papel biológico del gen, pero se desconoce su función.
    • Resumen en un informe de laboratorio escrito.

El propósito de la pasantía.

Esta especialización es útil para cualquier biólogo molecular moderno en el campo de las plantas que esté interesado en estar expuesto a los impresionantes datos disponibles para los investigadores. Durante las clases se hace alguna introducción a la programación en R en métodos de Bioinformática II, pero la mayoría de las herramientas son aplicaciones online.

requisitos técnicos
  • Se recomienda tener acceso a una computadora portátil o de escritorio.
  • Es posible que las herramientas no funcionen como aplicaciones móviles en un teléfono o tableta.

Proyecto de aprendizaje aplicado

La especialización en Bioinformática de Plantas en Coursera presenta habilidades y herramientas bioinformáticas básicas, como Genbank, Blast, alineamientos de secuencias múltiples y filogenética del NCBI en Bioinformática I, seguidas de interacciones proteína-proteína, bioinformática estructural y análisis de secuencias de ARN en Bioinformática II. En el curso de bioinformática de plantas incluimos 33 herramientas en línea exclusivas de las plantas, desde navegadores de genoma hasta extracción de datos de ARN, análisis de redes y promotores, y más. Finalmente, un curso de posgrado en bioinformática de plantas utiliza estas herramientas para formular hipótesis sobre el papel biológico de un gen cuyo. La función es desconocida, con resumen en un informe de laboratorio escrito.

Details of the courses that make up the specialization

Métodos Bioinformáticos I

Curso 1 • 19 horas • 4,7 (1.721 valoraciones)

Detalles del curso

¿Qué aprenderás?

  • Proyectos destacados en biología, como la secuenciación del genoma humano y los estudios de la expresión genética utilizando RNA-seq, microarrays y otras tecnologías, han generado una gran cantidad de datos para los biólogos.
  • El desafío que enfrentan los científicos es analizar e incluso acceder a estos datos para generar información útil relacionada con el sistema en estudio.
  • El curso se centra en el uso de recursos bioinformáticos existentes (principalmente programas y sitios web en Internet) para acceder a la abundancia de datos y responder preguntas relevantes para el biólogo promedio.
  • Los temas incluyen: alineación de secuencias múltiples, filogenética, análisis de datos de expresión genética y redes de interacción de proteínas.
la primera parte
  • Los Métodos Bioinformáticos I (it) se ocupan de bases de datos, Blast, alineación de secuencias múltiples, filogenética, análisis de selección y metagenómica.
la segunda parte
  • Bioinformatics Methods II se ocupa de la búsqueda de motivos, las interacciones proteína-proteína, la bioinformática estructural, el análisis de datos de expresión génica y la predicción de elementos cis.

habilidades que adquirirás

  • Categoría: análisis genético
  • categoría: Análisis bioinformático
  • categoría: evolución
  • Categoría: Genómica comparada

Métodos Bioinformáticos II

Curso 2 • 18 horas • 4,7 (478 valoraciones)

Detalles del curso

¿Qué aprenderás?

  • Proyectos destacados en biología, como la secuenciación del genoma humano y los estudios de la expresión genética utilizando RNA-seq, microarrays y otras tecnologías, han generado una gran cantidad de datos para los biólogos.
  • El desafío que enfrentan los científicos es analizar e incluso acceder a estos datos para generar información útil relacionada con el sistema en estudio.
  • El curso se centra en el uso de recursos bioinformáticos existentes (principalmente programas y sitios web en Internet) para acceder a la gran cantidad de datos y responder preguntas relevantes para el biólogo promedio.
la primera parte
  • Métodos Bioinformáticos Me ocupé de bases de datos, Blast, alineamiento de secuencias múltiples, filogenética, análisis de selección y metagenómica.
esta es la segunda parte
  • Bioinformatics Methods II cubrirá el descubrimiento de motivos, las interacciones proteína-proteína, la bioinformática estructural, el análisis de datos de expresión génica y la predicción de elementos cis.

habilidades que adquirirás

  • Utilizando muchas herramientas bioinformáticas.

Bioinformática Vegetal

Curso 3 • 13 horas • 4,8 (240 valoraciones)

Detalles del curso

¿Qué aprenderás?

  • Los últimos 15 años han sido apasionantes en el campo de la biología vegetal.
  • Se han secuenciado cientos de genomas de plantas y RNA-seq ha permitido un amplio perfil de expresión.
  • El aumento de los métodos basados ​​en «-seq» hizo posible determinar las interacciones proteína-proteína y proteína-ADN fácilmente y en gran cantidad.
  • Estos datos nos permiten crear hipótesis con un clic del ratón.

estructura

  • Cada uno de los seis módulos prácticos tiene una duración aproximada de seis semanas.
  • Una introducción de unos 2 minutos, una lección teórica de unos 20 minutos, un laboratorio práctico de una hora y media.
  • Discusión de laboratorio de unos 20 minutos si hay dificultades en el laboratorio, y un resumen de unos 2 minutos.

Platos cubiertos [materiales actualizados en junio de 2024]

  • Módulo 1: Bases de datos genómicas/árboles de genes precomputados/herramientas de proteínas.
  • Módulo 2: herramientas para la expresión.
  • Módulo 3: Herramientas de coexpresión.
  • Módulo 4: Análisis de Promotores.
  • Módulo 5: Análisis de enriquecimiento de GO y visualización de rutas.
  • Módulo 6: Explorando Redes.

Curso avanzado de bioinformática vegetal.

Curso 4 • 9 horas • 4,7 (27 valoraciones)

Detalles del curso

¿Qué aprenderás?

  • Los últimos 15 años han sido apasionantes en el campo de la biología vegetal.
  • Se han secuenciado cientos de genomas de plantas y RNA-seq ha permitido un amplio perfil de expresión.
  • En este curso usaremos herramientas para postular un papel biológico para un gen de función desconocida.

Este curso forma parte de la especialización en bioinformática vegetal.

  • Introduce habilidades y contenidos bioinformáticos clave.
  • Desarrollado con financiación de la Facultad de Artes y Ciencias de la Universidad de Toronto.