在线课程 – 多伦多大学植物生物信息学方法认证专业

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Suggested by: Coursera (What is Coursera?)

Professional Certificate

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No prior knowledge required

Time to complete the course

7-day free trial

No unnecessary risks

Skills you will acquire in the course

  • 学习技巧
  • 分析思维
  • 故障 排除
  • 沟通技巧
  • 团队 合作
  • 时间管理
  • 演讲技巧
  • 创造性思维
  • 战略思路
  • 研究技能

What you will learn in the course

Courses for which the course is suitable

  • 分子生物学家
  • 生物信息学家
  • 植物生物学研究员
  • RNA-seq 数据分析器
  • 系统发育学专家
  • 生物信息学工具开发人员
  • 研究蛋白质-蛋白质相互作用
  • 基因组数据分析器
  • 生物学数据挖掘专家
  • 分析启动子和遗传网络

专业化 – 四门课程系列

在过去的 15 年里,植物生物学领域发生了令人兴奋的变化。运行和扫描了数百个植物基因组,RNA-seq 技术能够大规模分析基因表达,而“基于 seq ”方法的普及使得以可承受的价格和大量确定蛋白质和 DNA 相互作用成为可能。这些数据集允许我们通过单击鼠标或触摸屏幕来创建假设。

课程内容

  • 生物信息学领域的基本技能和工具:
    • Genbank של NCBI
    • 爆炸
    • 多序列比对
    • 生物信息学中的哲学遗传学 I
  • 蛋白质-蛋白质相互作用
  • 结构生物信息学
  • 使用生物信息学 II 方法进行 RNA-seq 分析
  • 33 种独特的植物在线工具:
    • 基因组浏览器
    • RNA 数据挖掘
    • 推广者和网络分析
  • 植物生物信息学最后一门课程:
    • 其功能基因的生物学作用的假设尚不清楚
    • 书面实验室报告摘要

实习目的

这种专业化对于植物领域任何有兴趣接触到研究人员可用的令人印象深刻的数据的现代分子生物学家都很有用。在课程中,在生物信息学 II 方法中介绍了一些 R 编程,但大多数工具都是在线应用程序。

技术要求
  • 建议使用笔记本电脑或台式电脑。
  • Tools may not be funcionar so portable aplicações on a phone or tablet.

应用学习项目

Coursera 中的植物生物信息学专业介绍了生物信息学的基本技能和工具,例如 NCBI 的 Genbank、Blast、多序列比对和使用生物信息学 I 方法的系统发育学,然后是蛋白质-蛋白质相互作用、结构生物信息学和使用生物信息学 II 方法的 RNA-seq 分析。在植物生物信息学课程中,我们包括 33 种独特的植物在线工具,从基因组浏览器到 RNA 数据挖掘、启动子和网络分析等。最后,植物生物信息学的最后一门课程使用这些工具来假设功能未知的基因的生物学作用,并在书面实验室报告中进行总结。

Details of the courses that make up the specialization

生物信息学方法 I

课程 1 • 19 小时 • 4.7 (1,721 个等级)

课程详情

学习内容

  • 生物学领域的著名项目,例如使用 RNA-seq、微阵列和其他技术对人类基因组进行测序和基因表达调查,为生物学家创造了丰富的数据。
  • 科学家面临的挑战是分析甚至访问这些数据,以产生与所研究系统相关的有用信息。
  • 该课程侧重于使用现有的生物信息学资源(主要是 Internet 上的程序和网站)来访问大量数据并回答与普通生物学家相关的问题。
  • 主题包括:多序列比对、系统发育学、基因表达数据分析和蛋白质相互作用网络。
第一部分
  • 生物信息学方法 I (it) 涉及数据库、Blast、多序列比对、系统发育学、选择分析和 fry 基因组学。
第二部分
  • 生物信息学方法 II 涉及基序搜索、蛋白质-蛋白质相互作用、结构生物信息学、基因表达数据分析和 cis 成分预测。

您将获得的技能

  • 类别: 基因分析
  • 类别: 生物信息分析
  • 类别: 进化
  • 类别: 比较基因组学

生物信息学方法 II

课程 2 • 18 小时 • 4.7 (478 评分)

课程详情

学习内容

  • 生物学领域的著名项目,例如使用 RNA-seq、微阵列和其他技术对人类基因组进行测序和基因表达调查,为生物学家创造了丰富的数据。
  • 科学家面临的挑战是分析甚至访问这些数据,以产生与所研究系统相关的有用信息。
  • 该课程侧重于使用现有的生物信息学资源(主要是 Internet 上的程序和网站)来访问大量数据并回答与普通生物学家相关的问题。
第一部分
  • 生物信息学方法 我处理了数据库、Blast、多序列比对、系统发育学、选择分析和油炸基因组学。
这是第二部分
  • 生物信息学方法 II 将处理基序搜索、蛋白质-蛋白质相互作用、结构生物信息学、基因表达数据分析和 cis 成分预测。

您将获得的技能

  • 使用许多生物信息工具。

植物生物信息学

课程 3 • 13 小时 • 4.8 (240 评分)

课程详情

学习内容

  • 过去 15 年在植物生物学领域令人振奋。
  • 对数百个植物基因组进行了测序,RNA-seq 允许广泛的表达谱。
  • 基于“-seq”的方法的培养使得轻松、大量地测定蛋白质-蛋白质和蛋白质-DNA 相互作用成为可能。
  • 这些数据使我们能够通过单击鼠标来创建假设。

结构

  • 六个实践模块中的每一个都持续大约六周。
  • 介绍约 2 分钟,理论讲座约 20 分钟,实践实验约一个半小时。
  • 如果实验室中有困难,则进行大约 20 分钟的实验室讨论,并进行大约 2 分钟的总结。

涵盖的工具 [材料更新于 2024 年 6 月]

  • 模块 1:基因组数据库 / 预计算花园树木 / 蛋白质工具。
  • 模块 2:表达工具。
  • 模块 3:表情线工具。
  • 模块 4:启动子分析。
  • 模块 5:GO 丰富分析和轨道视觉。
  • 模块 6:网络研究。

植物生物信息学高级课程

课程 4 • 9 小时 • 4.7 (27 评分)

课程详情

学习内容

  • 过去 15 年在植物生物学领域令人振奋。
  • 对数百个植物基因组进行了测序,RNA-seq 允许广泛的表达谱。
  • 在本课程中,我们将使用工具为功能未知的基因承担生物学角色。

本课程是植物生物信息学专业的一部分

  • 介绍关键的生物信息技能和内容。
  • 由多伦多大学文理学院资助开发。