Онлайн-курс — сертифицированная профессиональная специализация по методам биоинформатики растений Университета Торонто.

Откройте для себя самую интересную информацию по различным темам, включая технологии, здравоохранение, культуру и многое другое. Посетите наш сайт, чтобы получить вдохновляющий контент и профессиональную информацию.

Suggested by: Coursera (What is Coursera?)

Professional Certificate

начиная

No prior knowledge required

Time to complete the course

7-day free trial

No unnecessary risks

Skills you will acquire in the course

  • методы обучения
  • Аналитическое мышление
  • решение проблем
  • коммуникативные навыки
  • работа в команде
  • тайм-менеджмент
  • Навыки презентации
  • Творческое мышление
  • Стратегические мысли
  • Исследовательские навыки

What you will learn in the course

Courses for which the course is suitable

  • молекулярный биолог
  • Биоинформатик
  • Исследователь в области биологии растений
  • Анализ данных секвенирования РНК
  • Эксперт по филогенетике
  • Разработчик биоинформатических инструментов
  • Исследует белок-белковые взаимодействия.
  • Анализатор геномных данных
  • Эксперт по интеллектуальному анализу данных в биологии
  • Анализирует промоторы и генетические сети

Стажировка — серия из четырех курсов

За последние 15 лет в области биологии растений произошли захватывающие изменения. Были секвенированы и отсканированы сотни геномов растений, технология RNA-seq позволила профилировать экспрессию генов на широком уровне, а распространение методов, основанных на «-seq», позволило определить взаимодействия между белками, а также между белками и ДНК на разных уровнях. доступные цены и в больших количествах. Эти наборы данных позволяют нам генерировать гипотезы одним щелчком мыши или прикосновением к экрану.

Содержание курса

  • Базовые навыки и инструменты в области биоинформатики:
    • Генбанк NCBI
    • Взрыв
    • Множественное выравнивание последовательностей
    • Филогенетика с использованием методов биоинформатики I
  • Белково-белковые взаимодействия
  • Структурная биоинформатика
  • RNA-seq анализ методами биоинформатики II
  • 33 уникальных онлайн-инструмента для растений:
    • Геномные браузеры
    • Интеллектуальный анализ данных РНК
    • Промоутер и сетевой анализ
  • Заключительный курс по биоинформатике растений:
    • Выдвигая гипотезу о биологической роли гена, его функция неизвестна.
    • Резюме в письменном лабораторном отчете

Цель стажировки

Эта специализация полезна для любого современного молекулярного биолога в области растений, который заинтересован в ознакомлении с впечатляющими данными, доступными исследователям. Во время занятий происходит некоторое знакомство с программированием на R в методах Биоинформатики II, но большинство инструментов представляют собой онлайн-приложения.

технические требования
  • Рекомендуется иметь доступ к ноутбуку или настольному компьютеру.
  • Инструменты могут не работать как мобильные приложения на телефоне или планшете.

Прикладной учебный проект

Специализация «Биоинформатика растений» на Coursera знакомит с базовыми навыками и инструментами биоинформатики, такими как Genbank NCBI, Blast, множественное выравнивание последовательностей и филогенетика в «Биоинформатике I», за которыми следуют белок-белковые взаимодействия, структурная биоинформатика и анализ секвенирования РНК в «Биоинформатика II». В курс биоинформатики растений мы включаем 33 онлайн-инструмента, уникальных для растений: от браузеров генома до анализа данных РНК, анализа промоторов и сетей и т. д. Наконец, в аспирантуре по биоинформатике растений эти инструменты используются для выдвижения гипотезы о биологической роли гена, чей ген. Функция неизвестна, краткое изложение содержится в письменном лабораторном отчете.

Details of the courses that make up the specialization

Методы биоинформатики I

Курс 1 • 19 часов • 4,7 (1721 оценка)

Детали курса

чему ты научишься

  • Выдающиеся проекты в биологии, такие как секвенирование генома человека и исследования экспрессии генов с использованием секвенирования РНК, микрочипов и других технологий, предоставили биологам огромное количество данных.
  • Задача, стоящая перед учеными, состоит в том, чтобы проанализировать и даже получить доступ к этим данным для извлечения полезной информации, связанной с изучаемой системой.
  • Курс фокусируется на использовании существующих биоинформатических ресурсов – в основном программ и веб-сайтов в Интернете – для доступа к огромному количеству данных и ответов на вопросы, актуальные для среднего биолога.
  • Темы включают в себя: множественное выравнивание последовательностей, филогенетику, анализ данных об экспрессии генов и сети взаимодействия белков.
Первая часть
  • Методы биоинформатики I (It) связаны с базами данных, Blast, множественным выравниванием последовательностей, филогенетикой, селекционным анализом и метагеномикой.
Вторая часть
  • Методы биоинформатики II занимаются поиском мотивов, белок-белковыми взаимодействиями, структурной биоинформатикой, анализом данных экспрессии генов и предсказанием цис-элементов.

навыки, которые вы приобретете

  • Категория: генетический анализ
  • Категория: Биоинформатический анализ
  • Категория: Эволюция
  • Категория: Сравнительная геномика

Методы биоинформатики II

Курс 2 • 18 часов • 4,7 (478 оценок)

Детали курса

чему ты научишься

  • Выдающиеся проекты в биологии, такие как секвенирование генома человека и исследования экспрессии генов с использованием секвенирования РНК, микрочипов и других технологий, предоставили биологам огромное количество данных.
  • Задача, стоящая перед учеными, состоит в том, чтобы проанализировать и даже получить доступ к этим данным для извлечения полезной информации, связанной с изучаемой системой.
  • Курс фокусируется на использовании существующих биоинформатических ресурсов – в основном программ и веб-сайтов в Интернете – для доступа к огромному количеству данных и ответов на вопросы, актуальные для среднего биолога.
Первая часть
  • Методы биоинформатики. Я занимался базами данных, Blast, множественным выравниванием последовательностей, филогенетикой, селекционным анализом и метагеномикой.
Это вторая часть
  • Методы биоинформатики II будут охватывать обнаружение мотивов, белок-белковые взаимодействия, структурную биоинформатику, анализ данных экспрессии генов и предсказание цис-элементов.

навыки, которые вы приобретете

  • Использование множества биоинформатических инструментов.

Биоинформатика растений

Курс 3 • 13 часов • 4,8 (240 оценок)

Детали курса

чему ты научишься

  • Последние 15 лет были интересными в области биологии растений.
  • Были секвенированы сотни геномов растений, секвенирование РНК позволило получить широкий профиль экспрессии.
  • Увеличение количества методов, основанных на «-seq», позволило легко и в больших количествах определять взаимодействия белок-белок и белок-ДНК.
  • Эти данные позволяют нам создавать гипотезы одним щелчком мыши.

структура

  • Каждый из шести практических модулей длится примерно шесть недель.
  • Введение около 2 минут, теоретическая лекция около 20 минут, практическая лабораторная работа полтора часа.
  • Лабораторное обсуждение около 20 минут при возникновении затруднений в лаборатории и подведение итогов около 2 минут.

Блюда накрыты [материалы обновлены в июне 2024 г.]

  • Модуль 1: Геномные базы данных/предварительно рассчитанные генные деревья/белковые инструменты.
  • Модуль 2: инструменты самовыражения.
  • Модуль 3: Инструменты совместного выражения.
  • Модуль 4: Анализ промоутера.
  • Модуль 5: Анализ обогащения ГО и визуализация путей.
  • Модуль 6: сетевые исследования.

Продвинутый курс по биоинформатике растений

Курс 4 • 9 часов • 4.7 (27 оценок)

Детали курса

чему ты научишься

  • Последние 15 лет были интересными в области биологии растений.
  • Были секвенированы сотни геномов растений, секвенирование РНК позволило получить широкий профиль экспрессии.
  • В этом курсе мы будем использовать инструменты для постулирования биологической роли гена с неизвестной функцией.

Этот курс является частью специализации «Биоинформатика растений».

  • Знакомит с ключевыми биоинформатическим навыками и содержанием.
  • Разработано при финансовой поддержке факультета искусств и наук Университета Торонто.