Een reis naar de voorhoede van computationele biologie. Leer bio-informaticasoftware en computationele methoden in de moderne biologie.
Suggested by: Coursera (What is Coursera?)
No prior knowledge required
No unnecessary risks
Doe mee met een van de 50 beste cursussen aller tijden!
Wanneer je deze specialisatie hebt afgerond, leer je hoe je vragen in de moderne biologie kunt beantwoorden met behulp van computationele methoden.
Als je geïnteresseerd bent in programmeren, hebben we een “track of Excellence” waarmee je de bioinformatische algoritmen kunt implementeren via code-uitdagingen.
Leer meer over de hoofdvak bio-informatica door onze speciale video te bekijken.
U kunt het gedrukte boek van de specialisatie Bioinformatic Algorithms: An Active Learning Approach kopen op de website van het boek.
Onze eerste cursus, ‘Zoeken naar verborgen berichten in DNA’, werd door Class Central uitgeroepen tot een van de 50 beste cursussen aller tijden!
Wat je gaat leren: Deze cursus begint met een reeks lessen die de kracht van computers in de moderne biologie demonstreren. We gaan DNA-replicatie onderzoeken en vragen ons af: waar in het genoom begint de DNA-replicatie? We gaan algoritmes toepassen om te zoeken naar verborgen boodschappen in het genoom.
In de tweede helft van de cursus gaan we onderzoeken welke DNA-patronen de rol van moleculaire klokken spelen. We zullen willekeurige algoritmen toepassen om problemen op te lossen.
Ten slotte experimenteer je met bestaande softwaretools om terugkerende biologische motieven te vinden.
Vaardigheden die je opdoet: bio-informatica, grafentheorie, algoritmen, programmeren in Python.
Wat je leert: We leren hoe je de grafentheorie kunt gebruiken om genomen uit korte stukjes DNA samen te stellen. We zullen antibiotica en problemen met genoomsequencing bespreken.
Ten slotte leer je hoe je populaire bio-informatica-instrumenten kunt toepassen om het genoom van een Staphylococcus-bacterie te sequencen.
Vaardigheden die je opdoet: algoritmen, programmeren in Python, sequencing van het hele genoom, dynamisch programmeren.
Wat je gaat leren: We vergelijken korte biologische sequenties en gebruiken dynamisch programmeren om het aantal mutaties tussen genen/eiwitten te bepalen.
In de tweede helft zullen we hele genomen vergelijken en zien hoe combinatorische algoritmen ons kunnen helpen genoomveranderingen te begrijpen.
Vaardigheden die je opdoet: bio-informatica, dynamisch programmeren, algoritmen.
Wat je zult leren: Er zal een “levensboom” worden gebouwd die laat zien hoe organismen verwant zijn. We zullen benaderingen bespreken voor het bouwen van evolutionaire bomen.
We zullen de relatie tussen vogels en dinosauriërs onderzoeken en methoden uit computationele proteomics gebruiken.
Vaardigheden die je opdoet: bio-informatica, programmeren in Python, algoritmen.
Wat je gaat leren: We zullen algoritmen presenteren voor het clusteren van een groep objecten en we zullen zien hoe de algoritmen kunnen worden toegepast op genexpressiegegevens.
We zullen een ander klassiek hulpmiddel in de datawetenschap introduceren, genaamd principale componentenanalyse.
Vaardigheden die je opdoet: bio-informatica, algoritmen, programmeren in Python.
Wat je gaat leren: (cursusinhoud niet vermeld)
Vaardigheden die je opdoet: (vaardigheden niet vermeld)
