دورة عبر الإنترنت – تخصص احترافي معتمد في أساليب المعلوماتية الحيوية النباتية من جامعة تورنتو

اكتشف المعلومات الأكثر إثارة للاهتمام حول مواضيع مختلفة، بما في ذلك التكنولوجيا والصحة والثقافة وأكثر من ذلك. تفضل بزيارة موقعنا الإلكتروني للحصول على محتوى ملهم ومعلومات احترافية.

Suggested by: Coursera (What is Coursera?)

Professional Certificate

البدء

No prior knowledge required

Time to complete the course

7-day free trial

No unnecessary risks

Skills you will acquire in the course

  • تقنيات التعلم
  • التفكير التحليلي
  • حل المشكلة
  • مهارات الاتصال
  • العمل الجماعي
  • إدارة الوقت
  • مهارات العرض
  • التفكير الإبداعي
  • أفكار استراتيجية
  • مهارات البحث

What you will learn in the course

Courses for which the course is suitable

  • عالم الأحياء الجزيئية
  • المعلوماتية الحيوية
  • باحث في مجال بيولوجيا النبات
  • تحليل بيانات RNA-seq
  • خبير في علم الوراثة
  • مطور أدوات المعلوماتية الحيوية
  • يبحث في تفاعلات البروتين البروتين
  • محلل بيانات الجينوم
  • خبير في استخراج البيانات في علم الأحياء
  • يحلل المروجين والشبكات الوراثية

التدريب – سلسلة من أربع دورات

على مدى السنوات الخمس عشرة الماضية، كانت هناك تغييرات مثيرة في مجال بيولوجيا النبات. تم تسلسل مئات من الجينومات النباتية ومسحها ضوئيًا، ومكنت تقنية RNA-seq من تحديد ملامح التعبير الجيني على مستوى واسع، كما أتاح انتشار الأساليب المعتمدة على “-seq” تحديد التفاعلات بين البروتينات وبين البروتينات والحمض النووي على مستوى العالم. بأسعار معقولة وبكميات كبيرة. تتيح لنا مجموعات البيانات هذه إنشاء فرضيات بنقرة على الفأرة أو لمسة على الشاشة.

محتوى الدورة

  • المهارات والأدوات الأساسية في مجال المعلوماتية الحيوية:
    • بنك الجينات من NCBI
    • انفجار
    • محاذاة تسلسل متعددة
    • علم الوراثة باستخدام طرق المعلوماتية الحيوية I
  • تفاعلات البروتين البروتين
  • المعلوماتية الحيوية الهيكلية
  • تحليل RNA-seq باستخدام طرق المعلوماتية الحيوية II
  • 33 أداة فريدة عبر الإنترنت للنباتات:
    • متصفحات الجينوم
    • استخراج بيانات الحمض النووي الريبي
    • تحليلات المروج والشبكة
  • الدورة النهائية في المعلوماتية الحيوية النباتية:
    • إن افتراض الدور البيولوجي للجين ووظيفته غير معروف
    • ملخص في تقرير مختبر مكتوب

الغرض من التدريب

يعد هذا التخصص مفيدًا لأي عالم أحياء جزيئي حديث في مجال النباتات مهتم بالتعرف على البيانات الرائعة المتاحة للباحثين. خلال الفصول الدراسية، هناك بعض المقدمة لبرمجة R في أساليب Bioinformatics II، ولكن معظم الأدوات عبارة عن تطبيقات عبر الإنترنت.

المتطلبات الفنية
  • يوصى بالوصول إلى جهاز كمبيوتر محمول أو كمبيوتر مكتبي.
  • قد لا تعمل الأدوات كتطبيقات جوال على الهاتف أو الجهاز اللوحي.

مشروع التعلم التطبيقي

يقدم تخصص المعلوماتية الحيوية النباتية في Coursera مهارات وأدوات المعلوماتية الحيوية الأساسية، مثل Genbank وBlast ومحاذاة التسلسلات المتعددة وعلم الوراثة في المعلوماتية الحيوية I، تليها تفاعلات البروتين والبروتين والمعلوماتية الحيوية الهيكلية وتحليل RNA-seq في المعلوماتية الحيوية II. في دورة المعلوماتية الحيوية النباتية، نقوم بتضمين 33 أداة عبر الإنترنت فريدة من نوعها للنباتات، بدءًا من متصفحات الجينوم إلى استخراج بيانات الحمض النووي الريبي (RNA)، وتحليلات المروج والشبكات، والمزيد. أخيرًا، تستخدم دورة الدراسات العليا في المعلوماتية الحيوية النباتية هذه الأدوات لافتراض الدور البيولوجي للجين الوظيفة غير معروفة، مع ملخص في تقرير مختبر مكتوب.

Details of the courses that make up the specialization

طرق المعلوماتية الحيوية I

الدورة 1 • 19 ساعة • 4.7 (1,721 تقييمًا)

تفاصيل الدورة

ماذا ستتعلم

  • لقد ولدت المشاريع البارزة في علم الأحياء، مثل تسلسل الجينوم البشري ومسوحات التعبير الجيني باستخدام RNA-seq، والمصفوفات الدقيقة وغيرها من التقنيات، ثروة من البيانات لعلماء الأحياء.
  • التحدي الذي يواجه العلماء هو تحليل هذه البيانات وحتى الوصول إليها لتوليد معلومات مفيدة تتعلق بالنظام قيد الدراسة.
  • تركز الدورة على استخدام موارد المعلومات الحيوية الموجودة – وخاصة البرامج والمواقع على شبكة الإنترنت – للوصول إلى وفرة البيانات والإجابة على الأسئلة ذات الصلة بعالم الأحياء العادي.
  • تشمل المواضيع: محاذاة التسلسلات المتعددة، وعلم الوراثة، وتحليل بيانات التعبير الجيني، وشبكات تفاعل البروتين.
الجزء الأول
  • طرق المعلوماتية الحيوية 1 (هي) تتعامل مع قواعد البيانات، والانفجار، ومحاذاة التسلسل المتعدد، وعلم الوراثة، وتحليل الاختيار وعلم الميتاجينوميات.
الجزء الثاني
  • تتعامل طرق المعلوماتية الحيوية II مع إيجاد الحافز، والتفاعلات بين البروتين والبروتين، والمعلوماتية الحيوية الهيكلية، وتحليل بيانات التعبير الجيني، والتنبؤ بعناصر رابطة الدول المستقلة.

المهارات التي سوف تكتسبها

  • التصنيف: التحليل الجيني
  • التصنيف: تحليل المعلومات الحيوية
  • فئة: تطور
  • التصنيف: علم الجينوم المقارن

طرق المعلوماتية الحيوية II

الدورة 2 • 18 ساعة • 4.7 (478 تقييمًا)

تفاصيل الدورة

ماذا ستتعلم

  • لقد ولدت المشاريع البارزة في علم الأحياء، مثل تسلسل الجينوم البشري ومسوحات التعبير الجيني باستخدام RNA-seq، والمصفوفات الدقيقة وغيرها من التقنيات، ثروة من البيانات لعلماء الأحياء.
  • التحدي الذي يواجه العلماء هو تحليل هذه البيانات وحتى الوصول إليها لاستخراج معلومات مفيدة تتعلق بالنظام قيد الدراسة.
  • تركز الدورة على استخدام موارد المعلومات الحيوية الموجودة – وخاصة البرامج والمواقع على الإنترنت – للوصول إلى ثروة البيانات والإجابة على الأسئلة ذات الصلة بعالم الأحياء العادي.
الجزء الأول
  • طرق المعلوماتية الحيوية لقد تعاملت مع قواعد البيانات، والانفجار، ومحاذاة التسلسلات المتعددة، وعلم الوراثة، وتحليل الاختيار وعلم الجينوم الفوقي.
هذا هو الجزء الثاني
  • ستغطي طرق المعلوماتية الحيوية II اكتشاف العناصر، وتفاعلات البروتين مع البروتين، والمعلوماتية الحيوية الهيكلية، وتحليل بيانات التعبير الجيني، والتنبؤ بعناصر رابطة الدول المستقلة.

المهارات التي سوف تكتسبها

  • استخدام العديد من أدوات المعلوماتية الحيوية.

المعلوماتية الحيوية النباتية

الدورة 3 • 13 ساعة • 4.8 (240 تقييمًا)

تفاصيل الدورة

ماذا ستتعلم

  • كانت السنوات الخمس عشرة الماضية مثيرة في مجال بيولوجيا النبات.
  • تم تسلسل المئات من الجينومات النباتية، وقد أتاح RNA-seq ملف تعريف واسع النطاق.
  • أتاحت الزيادة في الأساليب المعتمدة على “-seq” تحديد تفاعلات البروتين والبروتين والبروتين والحمض النووي بسهولة وبكمية عالية.
  • تتيح لنا هذه البيانات إنشاء فرضيات بنقرة واحدة على الفأرة.

بناء

  • تستمر كل وحدة من الوحدات العملية الست حوالي ستة أسابيع.
  • مقدمة حوالي دقيقتين، ومحاضرة نظرية حوالي 20 دقيقة، ومختبر عملي لمدة ساعة ونصف.
  • المناقشة المعملية حوالي 20 دقيقة إذا كانت هناك صعوبات في المعمل، والملخص حوالي دقيقتين.

الأطباق المغطاة [تم تحديث المواد في يونيو 2024]

  • الوحدة الأولى: قواعد البيانات الجينومية / أشجار الجينات المحوسبة مسبقًا / أدوات البروتين.
  • الوحدة الثانية: أدوات التعبير.
  • الوحدة 3: أدوات التعبير المشترك.
  • الوحدة 4: تحليل المروج.
  • الوحدة 5: تحليل تخصيب GO وتصور المسار.
  • الوحدة 6: استكشاف الشبكات.

دورة متقدمة في المعلوماتية الحيوية النباتية

الدورة 4 • 9 ساعات • 4.7 (27 تقييمًا)

تفاصيل الدورة

ماذا ستتعلم

  • كانت السنوات الخمس عشرة الماضية مثيرة في مجال بيولوجيا النبات.
  • تم تسلسل المئات من الجينومات النباتية، وقد أتاح RNA-seq ملف تعريف واسع النطاق.
  • في هذه الدورة سوف نستخدم أدوات لافتراض الدور البيولوجي لجين ذو وظيفة غير معروفة.

يعد هذا المقرر جزءا من التخصص في المعلوماتية الحيوية النباتية

  • يقدم المهارات والمحتوى الأساسي للمعلومات الحيوية.
  • تم تطويره بتمويل من كلية الآداب والعلوم بجامعة تورنتو.